副結(jié)核病臨床癥狀主要是慢性漸進(jìn)性消耗及下痢。在牛感染初期的病癥是週期間歇性下痢，病原在小腸壁增殖，
病灶常侷限于小腸壁以及腸繫膜淋巴結(jié)，隨病程演進(jìn)及個體差異，

病畜抗體產(chǎn)生后可能完全排除病原，或持續(xù)性感染變成外表健康的次臨床期動物。部份動物的病原則持續(xù)增殖，慢慢造成病灶擴(kuò)大、腸道代謝的干擾以及癥狀的出現(xiàn)，
肉眼病變可見于迴腸、空腸、小腸末端、盲腸、結(jié)腸等處。而在其他小反芻獸，下痢比較少見。小腸的病灶會造成蛋白質(zhì)漏失及吸收不良癥，導(dǎo)致產(chǎn)乳量下降及肌肉消耗等經(jīng)濟(jì)損失。
次臨床期動物會由糞便持續(xù)排出不等量的病原菌，而發(fā)病動物糞便中更含有大量的病原。這些早期感染及次臨床期動物讓 本病有冰山效應(yīng)的特性，一旦有一頭臨床病癥的動物出現(xiàn)，
代表著已經(jīng)有一群動物被感染但卻未顯出癥狀，
如果 5% 死亡率發(fā)生時(shí)，即可推斷約有 50% 的動物已受感染。